С 26-30 апреля 2021 года проведено комплексное обследование бассейна реки на предмет выявления всех источников загрязнения и других факторов негативного воздействия на её экосистему. В ходе проведенных обследований были отобраны пробы в местах, где наблюдаются сбросы сточных вод, на трансграничных территориях. Был проведен визуальный осмотр состояния водных объектов, его прибрежной зоны, проведены гидрологические обследования. В местах предполагаемого источника загрязнения проведено измерение уровня загрязнения воздуха по 6 показателям (сероводород, формальдегид, аммиак, диоксид серы, оксид азота, диоксид азота) и гидрохимический анализ качества воды — по 33-38 показателям. По итогам комплексного обследования на территории Западно-Казахстанской и Актюбинской областей установлено качество воды 4-го и 5-го класса, в Атырауской области — 1-го — 4-го класса", — сообщили в ведомстве.

В районе посёлка Индербор Индерского района на берегах найдены коммунальные отходы, отходы автотранспортных средств, древесина и другой мусор. В верхней и нижней частях Центрального моста Индербор обнаружены под водой бесхозные суда, загрязняющие реку".